Sinds een aantal jaren bestaat bij Proteus-Eretes het vlotensysteem. Een vloot is een groep van ploegen die zich verenigen. Elke vloot neemt elk jaar een aantal C4-ploegjes dan wel eerstejaars op.
Het vlotensysteem is opgezet met verschillende doelen. Zo verbetert het systeem het contact tussen de eerstejaars en ouderejaars, wat makkelijk is voor het vinden van een coach en het gevoel van betrokkenheid bij de vereniging. Ook kunnen ploegen, wanneer zij een stuur zoeken, bij hun mede-vlootgenoten terecht. Tot slot wordt er natuurlijk vaak met de hele vloot geborreld.
Op Proteus-Eretes zijn een aantal leuke ontwikkelingen te zien, die het gevolg zijn van het vlotensysteem:
De huidige vloten zijn:
De Welvaart BV (sinds 2011)
D.S.D.V. MagnuM (sinds 2008)
Lef! (sinds 2005)
D.H.B.G. Delirium (sinds 1999)